– Nous sommes en 2029 et vous nous parlez encore de mutants ?
Le futur[[Ce film se déroule six ans après que Wolverine se soit réveillé en 2023 à la fin X-Men : Days of Future Past (2014). Cependant, il a été confirmé plus tard que les précédents films X-Men se déroulaient sur la Terre-10005, tandis que Logan se déroulait sur la Terre-17315.]] : aucun nouveau mutant n’est apparu depuis un quart de siècle. La raison est inconnue. La plupart des X-Men sont morts. Logan, alias Wolverine (Hugh Jackman), de même que Caliban (Stephen Merchant) savent pourquoi, mais ils n’en parlent pas. Ensemble, ils veillent sur le professeur Xavier (Patrick Stewart) âgé de 90 ans.
Logan a lui-même vieilli. Son pouvoir auto-guérisseur perd de son efficacité. Il est abordé par une infirmière (Elizabeth Rodriguez) qui lui propose, moyennant finance, d’escorter Laura (Dafne Kenn), une fillette de 11 ans[[L’actrice Dafne Keen avait onze ans au moment du tournage et n’était donc pas autorisée à entrer dans un casino. Pour l’épisode se déroulant dans le casino, certains plans ont été tournés avec Keen sur un fond vert, et d’autres scènes ont été tournées dans le casino avec une doublure, âgée de plus de 18 ans, mais d’une carrure similaire à celle de Keen.]] dans un endroit sûr baptisé : Eden. Mais Donald Pierce (Boyd Holbrook) et ses Reavers d’une compagnie de sécurité en ont également après elle.
Le film se déroule dans une atmosphère désespérée. Les X-Men, représentant le futur de l’humanité, ont disparu. Les derniers héros subissent le poids des ans et leurs super-pouvoirs deviennent plus une gêne qu’un atout.
Riche en surprises scénaristiques, ce nouveau volet des aventures de Wolverine nous présente un espoir et une nouvelle menace ayant paradoxalement la même origine.